123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1334 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  64.75 
 
 		 493 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  64.68 
 
 		 488 aa  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  100 
 
 		 489 aa  1011    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  64.96 
 
 		 493 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  65.16 
 
 		 493 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  65.71 
 
 		 490 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  60.41 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  42.54 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  39.63 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  38.74 
 
 		 509 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  39.48 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  38.79 
 
 		 514 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  37.86 
 
 		 493 aa  339  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  38.62 
 
 		 497 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  39.21 
 
 		 497 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  39.08 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  36.47 
 
 		 524 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  36.38 
 
 		 528 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  36.69 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  37.5 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  37.29 
 
 		 513 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  37.3 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  35.69 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  35.14 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  37.22 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  34.97 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  38.36 
 
 		 509 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  35.4 
 
 		 499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  34.43 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  38.46 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  38.01 
 
 		 504 aa  310  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  34.73 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  34.73 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  34.73 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  36.53 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  38.57 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  34.73 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  34.01 
 
 		 502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  34.73 
 
 		 505 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  34.53 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  34.73 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  34.53 
 
 		 505 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  37.18 
 
 		 502 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  38.08 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  34.13 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  33.93 
 
 		 505 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  36.36 
 
 		 539 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  36.29 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  36.29 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  34.36 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  36.09 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  35.1 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  34.34 
 
 		 493 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  34.21 
 
 		 500 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  37.32 
 
 		 497 aa  296  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  36.8 
 
 		 499 aa  296  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 		 507 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  34.39 
 
 		 505 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  37.93 
 
 		 499 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  34.18 
 
 		 494 aa  292  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  34.36 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  36.92 
 
 		 497 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  36.57 
 
 		 495 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  32.53 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  33.4 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  33.99 
 
 		 516 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0317  Carboxypeptidase Taq  34.08 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00666453  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  32.67 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  34.68 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  33.6 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  32.25 
 
 		 494 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  34.15 
 
 		 499 aa  280  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  34.82 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  33.6 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  34.12 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0383  Carboxypeptidase Taq  31.71 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  31.26 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  33.81 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  33.94 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  35.33 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  35.49 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  33.27 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  33.06 
 
 		 482 aa  270  5.9999999999999995e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  32.33 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  33.6 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  32.92 
 
 		 491 aa  269  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  29.92 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  33.67 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  35.01 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  33.4 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  32.37 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  33.4 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  32.72 
 
 		 501 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  32.86 
 
 		 501 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  32.72 
 
 		 501 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  35.26 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  33.26 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  31.73 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  32.7 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>