123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0104 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  85.71 
 
 
491 aa  889    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  83.88 
 
 
490 aa  872    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  100 
 
 
490 aa  994    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  84.32 
 
 
491 aa  871    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  55.06 
 
 
497 aa  548  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  51.61 
 
 
501 aa  524  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  52.27 
 
 
482 aa  520  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0847  Carboxypeptidase Taq  50.1 
 
 
467 aa  472  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  40.78 
 
 
491 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  40.64 
 
 
506 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  39.28 
 
 
507 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  39.55 
 
 
500 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  39.18 
 
 
490 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  40.4 
 
 
509 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  38.57 
 
 
499 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  38.48 
 
 
508 aa  346  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  37.4 
 
 
500 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  41.91 
 
 
497 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  39.27 
 
 
514 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  36.66 
 
 
509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  39.39 
 
 
497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  37.3 
 
 
505 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  37.7 
 
 
505 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  37.7 
 
 
505 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  37.7 
 
 
505 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  37.7 
 
 
505 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  37.5 
 
 
505 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  36.36 
 
 
505 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  35.85 
 
 
502 aa  329  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  37.1 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  36.57 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  37.1 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  37.4 
 
 
501 aa  326  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  37.42 
 
 
502 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  37.45 
 
 
493 aa  324  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  37.01 
 
 
507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  35.69 
 
 
507 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  36.12 
 
 
497 aa  317  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  35.38 
 
 
524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  36.38 
 
 
505 aa  309  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  35.91 
 
 
507 aa  307  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  36.42 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  35.61 
 
 
499 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  33.94 
 
 
493 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  35.56 
 
 
525 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  37.5 
 
 
528 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  35.12 
 
 
499 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  32.86 
 
 
501 aa  296  6e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  35.37 
 
 
512 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  34.95 
 
 
509 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  34.79 
 
 
503 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  36.48 
 
 
490 aa  291  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  35.15 
 
 
501 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  34.58 
 
 
498 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  33.94 
 
 
494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  34.21 
 
 
509 aa  286  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  33.95 
 
 
498 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  35.6 
 
 
495 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  34.57 
 
 
497 aa  286  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  31.05 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  34.77 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  34.88 
 
 
499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  33.4 
 
 
582 aa  283  5.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  30.83 
 
 
493 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  32.93 
 
 
501 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  32.19 
 
 
493 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  36.02 
 
 
497 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  32.72 
 
 
490 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  32.45 
 
 
490 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0317  Carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 
518 aa  281  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00666453  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  32.52 
 
 
497 aa  280  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  32.87 
 
 
524 aa  280  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  31.53 
 
 
501 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  34.06 
 
 
504 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  34.36 
 
 
496 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  32.26 
 
 
494 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  31.73 
 
 
494 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  31.33 
 
 
501 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  31.06 
 
 
501 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  31.31 
 
 
501 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  34.95 
 
 
502 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  31.33 
 
 
501 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  33.95 
 
 
513 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  33.6 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  35.09 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  35.48 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  34.83 
 
 
488 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  35.31 
 
 
493 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  35.31 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  34.17 
 
 
498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  33.78 
 
 
539 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  33.94 
 
 
496 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  31.43 
 
 
501 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  32.65 
 
 
494 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  32.92 
 
 
499 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  33.26 
 
 
504 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  32.92 
 
 
499 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 
493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  33.88 
 
 
490 aa  270  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  34.1 
 
 
501 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>