123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1978 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  100 
 
 
528 aa  1087    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  54.89 
 
 
502 aa  561  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  55.44 
 
 
493 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  44.62 
 
 
507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  41.9 
 
 
508 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  38.13 
 
 
491 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  42.4 
 
 
505 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  39.2 
 
 
507 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  38.54 
 
 
506 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  38.38 
 
 
502 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  41.45 
 
 
514 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  39.79 
 
 
501 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  38.99 
 
 
499 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  40.37 
 
 
503 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  42.04 
 
 
509 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  40.97 
 
 
513 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  38.88 
 
 
505 aa  360  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  40.89 
 
 
498 aa  359  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  40.97 
 
 
507 aa  359  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  38.63 
 
 
524 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  39.48 
 
 
497 aa  355  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  39.92 
 
 
488 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  37.12 
 
 
505 aa  349  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 
505 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 
505 aa  349  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  36.92 
 
 
505 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  36.92 
 
 
505 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  36.92 
 
 
505 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  36.92 
 
 
505 aa  347  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  36.71 
 
 
505 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  36.71 
 
 
505 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  36.51 
 
 
505 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  36.62 
 
 
507 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  36.13 
 
 
500 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  39.84 
 
 
494 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  39.36 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  39.31 
 
 
490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  38.52 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  37.9 
 
 
525 aa  336  5.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  38.31 
 
 
499 aa  335  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  37.55 
 
 
512 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  38.31 
 
 
499 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  36.53 
 
 
490 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  38.1 
 
 
499 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  34.8 
 
 
500 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  39.16 
 
 
497 aa  333  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  38 
 
 
493 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  38 
 
 
493 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  38.2 
 
 
497 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  36.9 
 
 
524 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  39.66 
 
 
539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  38.03 
 
 
490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  36.38 
 
 
489 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  37.4 
 
 
493 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  36.42 
 
 
494 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  38.62 
 
 
498 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  36.64 
 
 
496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  37.25 
 
 
499 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  35.56 
 
 
494 aa  312  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  37.85 
 
 
496 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  36.9 
 
 
509 aa  312  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  36.36 
 
 
494 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  34.01 
 
 
493 aa  309  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  35.93 
 
 
490 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  36.81 
 
 
499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  35.32 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1781  Zn-dependent carboxypeptidase  35.88 
 
 
496 aa  307  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  36.75 
 
 
497 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  36.67 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  33.27 
 
 
493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  38.35 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  36.47 
 
 
501 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  39.44 
 
 
504 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  35.74 
 
 
501 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  38.18 
 
 
491 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  35.74 
 
 
501 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  36.68 
 
 
491 aa  302  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  34.76 
 
 
501 aa  302  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  38.49 
 
 
490 aa  301  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  37.5 
 
 
490 aa  300  4e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  35.54 
 
 
501 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  36 
 
 
504 aa  299  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  35.13 
 
 
501 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  36.07 
 
 
501 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  37.22 
 
 
498 aa  297  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  36.64 
 
 
493 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  35.14 
 
 
493 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  33.89 
 
 
493 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  32.87 
 
 
501 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  34.3 
 
 
582 aa  295  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  37.88 
 
 
495 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  36.4 
 
 
501 aa  293  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  33.27 
 
 
509 aa  292  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  35.53 
 
 
499 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  35.45 
 
 
497 aa  289  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  38.51 
 
 
499 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  36.58 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  39.12 
 
 
497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  35.97 
 
 
512 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1826  thermostable carboxypeptidase 1  32.56 
 
 
509 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>