123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0276 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  100 
 
 		 497 aa  997    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  72.32 
 
 		 499 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  70.3 
 
 		 499 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  65.05 
 
 		 501 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  93.33 
 
 		 498 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  98.19 
 
 		 497 aa  981    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  70.24 
 
 		 495 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  61.97 
 
 		 502 aa  614  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  61.09 
 
 		 499 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  57.95 
 
 		 512 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  57 
 
 		 497 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  55.28 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  49.39 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  51 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  45.77 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  48.48 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  47.48 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  47.48 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  47.28 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  44.67 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  42.22 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  45.55 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  47.17 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  41.62 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  44.94 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  43.64 
 
 		 490 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  44.94 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  40 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  44.53 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  42.34 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  43.43 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  41.65 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  44.74 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  44.74 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  44.02 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  44.74 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  44.33 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  44.02 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  42.48 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  45.31 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  43.06 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  44.74 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  40.46 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  40.12 
 
 		 505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  38.31 
 
 		 497 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  41.25 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  40.61 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  34.56 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  38.74 
 
 		 507 aa  326  7e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  36.99 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  38.69 
 
 		 514 aa  323  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  39.35 
 
 		 509 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  39.63 
 
 		 497 aa  319  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  38.07 
 
 		 509 aa  312  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  41.01 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  36.07 
 
 		 500 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  37.32 
 
 		 489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  32.79 
 
 		 502 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  35.15 
 
 		 507 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  39.54 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  35.22 
 
 		 500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  37.22 
 
 		 501 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  39.18 
 
 		 513 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  35.46 
 
 		 512 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  39.09 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  34.66 
 
 		 505 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  34.66 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  34.66 
 
 		 505 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  34.66 
 
 		 505 aa  297  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  34.45 
 
 		 505 aa  297  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  34.45 
 
 		 505 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  36.87 
 
 		 499 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  37.7 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  32.31 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  35.16 
 
 		 525 aa  296  8e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  38.05 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  39.38 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  39.38 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  38.74 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  34.24 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  34.03 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  34.03 
 
 		 505 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  34.03 
 
 		 505 aa  292  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  39.07 
 
 		 490 aa  292  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  34.58 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  35.68 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  34.85 
 
 		 490 aa  289  9e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  32.31 
 
 		 499 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  37.85 
 
 		 490 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  33.13 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  39.77 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  36.02 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  33.13 
 
 		 505 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  34.9 
 
 		 493 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  36.33 
 
 		 502 aa  280  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  31.89 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  34.01 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  34.2 
 
 		 491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  29.67 
 
 		 493 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  34.74 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>