123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0334 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  100 
 
 		 497 aa  1009    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  49.29 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  48.51 
 
 		 514 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  48.6 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  47.98 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  46.71 
 
 		 503 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  43.89 
 
 		 507 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  44.56 
 
 		 507 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  44.71 
 
 		 507 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  46.76 
 
 		 498 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  42.94 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  43.66 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  41.46 
 
 		 505 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  39.88 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  38.13 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  39.88 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  37.65 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  38.16 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  38.37 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  41.67 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  37.2 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  43.06 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  42.8 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  38.83 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  40.75 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  41.5 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  42.36 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  35.83 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  36.23 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  41.81 
 
 		 539 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  39.14 
 
 		 524 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  37.2 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  35.63 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  36.03 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  35.83 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  35.83 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  41.91 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  35.63 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  35.63 
 
 		 505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  35.83 
 
 		 505 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  35.83 
 
 		 505 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  35.22 
 
 		 505 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  38.64 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  40.25 
 
 		 491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  41.42 
 
 		 491 aa  333  6e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  38.2 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  40.97 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  38.31 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  36.79 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  40.41 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  42.05 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  38.37 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  39.92 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  39.68 
 
 		 497 aa  319  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  38.7 
 
 		 514 aa  319  7e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  35.71 
 
 		 501 aa  319  7.999999999999999e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  41.9 
 
 		 498 aa  319  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  34.96 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  37.58 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  40.12 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  34.66 
 
 		 493 aa  316  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  38.46 
 
 		 489 aa  312  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  40.44 
 
 		 504 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  39.71 
 
 		 493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  36.4 
 
 		 582 aa  306  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  41.41 
 
 		 497 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  39.67 
 
 		 493 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  39.67 
 
 		 493 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  41.14 
 
 		 499 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  39.19 
 
 		 512 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  41.01 
 
 		 497 aa  302  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  37.47 
 
 		 502 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  40.16 
 
 		 499 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0847  Carboxypeptidase Taq  36.06 
 
 		 467 aa  293  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  34.07 
 
 		 524 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  39.88 
 
 		 497 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  37.99 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  39.28 
 
 		 501 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  36.29 
 
 		 498 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  32.86 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  32.66 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  33.67 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  36.05 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  35.56 
 
 		 501 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0676  thermostable carboxypeptidase 1  37.3 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  35.15 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  35.35 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  33.74 
 
 		 501 aa  279  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  33.95 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  34.95 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04931  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  33.98 
 
 		 516 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  36.05 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  34.92 
 
 		 516 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  36.02 
 
 		 493 aa  272  9e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05571  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  29.6 
 
 		 501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  35.76 
 
 		 501 aa  270  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0383  Carboxypeptidase Taq  30.39 
 
 		 503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  33.54 
 
 		 490 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  34.94 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  35.37 
 
 		 499 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>