123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1685 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1826  thermostable carboxypeptidase 1  61.63 
 
 
509 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  100 
 
 
501 aa  1013    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0676  thermostable carboxypeptidase 1  79.92 
 
 
502 aa  777    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.203621 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05501  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  61.63 
 
 
509 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.30292 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  71.12 
 
 
516 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04931  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  64.38 
 
 
516 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05571  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  55.94 
 
 
501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0494  thermostable carboxypeptidase 1  54.73 
 
 
501 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.178515  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05201  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  54.12 
 
 
501 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.322027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  36.46 
 
 
507 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  35.39 
 
 
507 aa  302  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  32.34 
 
 
491 aa  298  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  34.3 
 
 
500 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  32.27 
 
 
505 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  37.59 
 
 
539 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  37.47 
 
 
514 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  32.17 
 
 
505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  32.17 
 
 
505 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  32.17 
 
 
505 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  32.17 
 
 
505 aa  289  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  31.67 
 
 
505 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  31.71 
 
 
505 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  37.99 
 
 
497 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  35.04 
 
 
524 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  31.97 
 
 
505 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  34.97 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  35.9 
 
 
497 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  31.76 
 
 
505 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  35.29 
 
 
508 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  37.71 
 
 
509 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  31.1 
 
 
505 aa  286  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  34.81 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  35.64 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  34.1 
 
 
500 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  31.08 
 
 
507 aa  275  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  34.66 
 
 
509 aa  274  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  35.46 
 
 
505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  30.62 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  34.14 
 
 
528 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  31.14 
 
 
506 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  31.93 
 
 
499 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  32.33 
 
 
489 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  32.78 
 
 
505 aa  269  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  34.69 
 
 
502 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  33.8 
 
 
490 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  35.08 
 
 
499 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  33.8 
 
 
490 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  35.9 
 
 
501 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  35.5 
 
 
501 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  36.54 
 
 
504 aa  260  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  35.5 
 
 
501 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  33.2 
 
 
488 aa  259  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  35.5 
 
 
501 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  33.73 
 
 
493 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  33.73 
 
 
493 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  33.53 
 
 
493 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  34.48 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  34.34 
 
 
501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  34.2 
 
 
502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  34.01 
 
 
497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  34.38 
 
 
509 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  36.63 
 
 
495 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  31.41 
 
 
512 aa  253  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  34.34 
 
 
501 aa  253  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  34.74 
 
 
513 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  35.17 
 
 
494 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  30.35 
 
 
501 aa  252  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  29.18 
 
 
490 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  34.34 
 
 
501 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  34.23 
 
 
499 aa  250  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  32.93 
 
 
514 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  30.92 
 
 
582 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  35.32 
 
 
512 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  33.13 
 
 
496 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  33.61 
 
 
499 aa  247  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 
509 aa  246  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  31.2 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  35.55 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  33.07 
 
 
493 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  31.12 
 
 
524 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  33.06 
 
 
496 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  33.6 
 
 
501 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  32.8 
 
 
503 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  29.39 
 
 
501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  31.26 
 
 
501 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  33.6 
 
 
501 aa  239  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  31.51 
 
 
490 aa  239  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  35.22 
 
 
498 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  34.94 
 
 
497 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  33.81 
 
 
494 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  33.27 
 
 
507 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  32.16 
 
 
501 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  27.14 
 
 
493 aa  236  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  35.8 
 
 
499 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  31.94 
 
 
499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  29.54 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  29.74 
 
 
493 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  30.16 
 
 
490 aa  234  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  34.33 
 
 
497 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  31.67 
 
 
490 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>