122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0880 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0880  carboxypeptidase  100 
 
 		 196 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  68.04 
 
 		 501 aa  294  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  67.53 
 
 		 501 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  67.01 
 
 		 501 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  67.01 
 
 		 501 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  68.75 
 
 		 501 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  68.75 
 
 		 501 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  68.23 
 
 		 501 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  68.23 
 
 		 497 aa  284  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  67.19 
 
 		 493 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  63.02 
 
 		 496 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  63.02 
 
 		 496 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  62.5 
 
 		 494 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  54.4 
 
 		 499 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  49.74 
 
 		 490 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  50 
 
 		 494 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  52.28 
 
 		 494 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  49.74 
 
 		 490 aa  217  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  48.98 
 
 		 524 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  48.47 
 
 		 496 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  50 
 
 		 494 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  51.03 
 
 		 499 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  51.03 
 
 		 499 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  47.96 
 
 		 493 aa  203  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  50 
 
 		 499 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  46.39 
 
 		 498 aa  197  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  46.39 
 
 		 504 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  45.13 
 
 		 512 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  46.23 
 
 		 501 aa  181  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  41.75 
 
 		 493 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  41.75 
 
 		 497 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  41.24 
 
 		 493 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  43.65 
 
 		 497 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  41.36 
 
 		 509 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  43.65 
 
 		 497 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  43.65 
 
 		 498 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  47.18 
 
 		 499 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  43.81 
 
 		 502 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  43.59 
 
 		 501 aa  164  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  42.08 
 
 		 500 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  42.56 
 
 		 495 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  42.13 
 
 		 500 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  43.59 
 
 		 499 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  40.31 
 
 		 499 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  40.31 
 
 		 491 aa  157  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  43.88 
 
 		 497 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  40.72 
 
 		 502 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  39.09 
 
 		 506 aa  154  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  38.78 
 
 		 501 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  40.1 
 
 		 514 aa  151  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  42.69 
 
 		 507 aa  151  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  35.79 
 
 		 582 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  40.82 
 
 		 504 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  36.27 
 
 		 508 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  37.5 
 
 		 491 aa  145  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  40.35 
 
 		 505 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  39.77 
 
 		 505 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  37.17 
 
 		 493 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  39.9 
 
 		 505 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  141  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  37.7 
 
 		 491 aa  141  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  36.32 
 
 		 490 aa  141  8e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  35.75 
 
 		 502 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  39.77 
 
 		 505 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1781  Zn-dependent carboxypeptidase  35.68 
 
 		 496 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  36.27 
 
 		 497 aa  140  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  39.18 
 
 		 505 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  40.67 
 
 		 524 aa  138  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  37.37 
 
 		 490 aa  138  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  42.5 
 
 		 490 aa  137  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  36.65 
 
 		 514 aa  137  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  38.78 
 
 		 528 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  38.92 
 
 		 497 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  34.38 
 
 		 501 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0317  Carboxypeptidase Taq  34.38 
 
 		 518 aa  134  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00666453  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  34.2 
 
 		 509 aa  134  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  38.62 
 
 		 507 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  33.51 
 
 		 499 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  37.44 
 
 		 507 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  37.56 
 
 		 509 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05571  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  38.82 
 
 		 501 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  37.17 
 
 		 482 aa  131  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  33.49 
 
 		 525 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  35.6 
 
 		 488 aa  130  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  36.25 
 
 		 509 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  42.04 
 
 		 501 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  34.69 
 
 		 503 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  34.38 
 
 		 493 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  34.36 
 
 		 499 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0494  thermostable carboxypeptidase 1  39.74 
 
 		 501 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.178515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  34.38 
 
 		 505 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  35.94 
 
 		 497 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  34.69 
 
 		 507 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  39.16 
 
 		 516 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  32.49 
 
 		 490 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>