216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0049 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0049  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 371 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0829396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2267  flagellar basal body P-ring protein  42.82 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  40.97 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  38.36 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  40.17 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  36.59 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  37.71 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  37.04 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  36.63 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  36.66 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  36.42 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  39.26 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  36.13 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  37.17 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  36.68 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  39.94 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  38.11 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  38.62 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  38.27 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  38.75 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  37.18 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  39.44 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  37.53 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  38.65 
 
 		 378 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  38.9 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  36.59 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1031  flagellar basal body P-ring protein  40.11 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0715097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  37.74 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  37.17 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  38.24 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  37.74 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  37.47 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  37.93 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  37 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1143  flagellar P-ring protein  37.2 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  38.07 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  37.08 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  36.39 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  36.63 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  36.14 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  36.56 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  38.12 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  37.39 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  37.3 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  37.87 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1636  flagellar basal body P-ring protein  35.23 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  37.1 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  36.68 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1810  flagellar basal body P-ring protein  35.23 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1455  flagellar basal body P-ring protein  35.23 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  38.07 
 
 		 370 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  36.36 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  36.36 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  37.68 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  36.08 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  38.1 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  36.41 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  36.99 
 
 		 372 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  35.08 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  36.07 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0562  flagellar basal body P-ring protein  35.36 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  35.37 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  36.24 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  35.83 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  37.82 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  35.29 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  35.64 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  34.83 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  34.83 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  34.93 
 
 		 380 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  34.83 
 
 		 391 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  35.2 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  38 
 
 		 377 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  36.71 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  35.16 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  35.12 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  35.36 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  36.97 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  35 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  35.47 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  35.99 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  35.12 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  37.47 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  34.96 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  35.18 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  37.1 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  34.96 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  35.66 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  38.04 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  35.43 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  35.28 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  35.39 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  37.22 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  35 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  36.78 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  33.86 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  37.86 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>