199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1195 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
139 aa  288  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0848344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
211 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
166 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1423  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.33 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 
229 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0067  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.29 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.2 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.888786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  27.48 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.61 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  29.32 
 
 
184 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.54 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.6 
 
 
180 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  30.34 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  26.15 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  26.15 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  25.96 
 
 
215 aa  52  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  22.86 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  28.09 
 
 
202 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  29.01 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  28.09 
 
 
218 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  28.09 
 
 
210 aa  50.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  29.21 
 
 
193 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  29.21 
 
 
193 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  24.8 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  24.8 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  28.09 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25.6 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25.6 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25.6 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25.6 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
208 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25.6 
 
 
180 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
208 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25.6 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  28.09 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  27.16 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
352 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
352 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0805152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.8 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0559  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.11 
 
 
544 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.65 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  30.34 
 
 
209 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0346  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  33.78 
 
 
352 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.715364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
574 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 
666 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.38 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
373 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  33.82 
 
 
582 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.92 
 
 
369 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.67 
 
 
397 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.568365  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.4 
 
 
368 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  28.4 
 
 
667 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.13 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 
370 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  35.29 
 
 
579 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  29.21 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  27.78 
 
 
645 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.9 
 
 
723 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  29.63 
 
 
653 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.43 
 
 
423 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.78 
 
 
545 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.29 
 
 
559 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.29 
 
 
559 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  34.85 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.48 
 
 
394 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  34.72 
 
 
582 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  36.84 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3264  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.56 
 
 
697 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  25 
 
 
615 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  32.86 
 
 
426 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0636  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.93 
 
 
558 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  32.84 
 
 
612 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  27.78 
 
 
645 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.38 
 
 
425 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  28.57 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  31.94 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  37.88 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1275  ferredoxin  28.68 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.03 
 
 
989 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.09 
 
 
541 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24 
 
 
368 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 
886 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  24.36 
 
 
207 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  36.21 
 
 
346 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2152  molybdopterin oxidoreductase  40.98 
 
 
880 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.16 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>