71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0574 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1092    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  52.22 
 
 		 530 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  44.79 
 
 		 543 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  28.4 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  29.24 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  26.77 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  26.73 
 
 		 558 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  28.9 
 
 		 510 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  30.22 
 
 		 498 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  27.71 
 
 		 331 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  29.91 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  23.31 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  34.19 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  35.33 
 
 		 672 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  28.57 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  28.32 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  31.65 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2677  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.79 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2099  hypothetical protein  27.74 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00838169  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3013  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5394  RNA-directed DNA polymerase  31.58 
 
 		 461 aa  50.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.172533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  23 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2008  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.57 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  32.05 
 
 		 727 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0248  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.41 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3200  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.91 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0412624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0288  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5268  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3877  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01305  RNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0791  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4399  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3099  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2818  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06379  RNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1956  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00339995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06609  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06317  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06996  Na-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0269  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0904325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3561  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.27 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02652  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01083  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2165  group II intron, maturase  29.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.052518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3326  group II intron, maturase  29.27 
 
 		 455 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214533  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00141  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00350  reverse transcriptase  29.63 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00759  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01296  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01811  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02426  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02975  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05463  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04800  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03670  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03119  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03030  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05916  RNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03266  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.25 
 
 		 731 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03017  RNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02490  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 		 731 aa  43.9  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3179  hypothetical protein  28.41 
 
 		 589 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3730  RNA-directed DNA polymerase  27.66 
 
 		 340 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.70483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1430  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.67 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2219  RNA-directed DNA polymerase  27.17 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.84 
 
 		 598 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27540  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.93 
 
 		 286 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>