20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2490 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1032    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  66.73 
 
 		 499 aa  710    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  43.25 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  30.45 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  30.22 
 
 		 527 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  36.64 
 
 		 533 aa  87.4  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  35 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  23.44 
 
 		 543 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  31.65 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  30.3 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  31.94 
 
 		 673 aa  77  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  28 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  30.77 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  26.51 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  29.45 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  30.27 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  25.16 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  27.65 
 
 		 555 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  24.2 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2214  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.48 
 
 		 364 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>