19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1069 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  684    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  35.97 
 
 		 533 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  32.63 
 
 		 557 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  32.82 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  33.57 
 
 		 558 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  28.62 
 
 		 510 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  27.71 
 
 		 527 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  33.56 
 
 		 533 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  22.34 
 
 		 543 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  24.6 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  24.43 
 
 		 673 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  22.02 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  26.21 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  27.06 
 
 		 505 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  26.51 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  29.2 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  22.11 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  27.14 
 
 		 566 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  26.95 
 
 		 555 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>