35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2087 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1111    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  31.79 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  32.32 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  27.81 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  35.97 
 
 		 331 aa  153  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  27.08 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  26.03 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  24.54 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  26.77 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  27.27 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  33.33 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  24.04 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  26.54 
 
 		 673 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  30.43 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  30.77 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  31.62 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  26.9 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  32.85 
 
 		 566 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  29.08 
 
 		 555 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0849  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.57 
 
 		 466 aa  47.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.141781  normal  0.131758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0883  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.57 
 
 		 466 aa  47.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00469922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  22.14 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  23.12 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  22.14 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2298  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.57 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3976  hypothetical protein  24.81 
 
 		 579 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.57 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000244111  hitchhiker  0.000000045445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0152  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.57 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  normal  0.510076 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0459  hypothetical protein  36.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00698134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2214  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.29 
 
 		 364 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2180  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.56 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27540  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.69 
 
 		 286 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1841  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.56 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2412  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.56 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3148  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.49 
 
 		 315 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.444355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>