21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0384 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1097    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  28.4 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  27.08 
 
 		 533 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  27.39 
 
 		 543 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  28.73 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  31.74 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  24.4 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  25.16 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  38.67 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  27.24 
 
 		 673 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  33.56 
 
 		 331 aa  94  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  38.17 
 
 		 499 aa  90.1  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  36.64 
 
 		 498 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  26.4 
 
 		 670 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  32.18 
 
 		 672 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  25.55 
 
 		 667 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  28.1 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.46 
 
 		 343 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3976  hypothetical protein  26.44 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 454 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>