14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3976 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1196    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2569  hypothetical protein  25.87 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  25.44 
 
 		 555 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  26.47 
 
 		 566 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  23.3 
 
 		 673 aa  47.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  26.44 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  26.7 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  24.81 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3598  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  29.46 
 
 		 374 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  26.8 
 
 		 512 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2053  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.29 
 
 		 465 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3179  hypothetical protein  29.38 
 
 		 589 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  27.07 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  31.58 
 
 		 543 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>