23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1305 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1381    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  31.99 
 
 
670 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  31.86 
 
 
672 aa  308  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  27.13 
 
 
667 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  30 
 
 
543 aa  99.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  27.24 
 
 
533 aa  94.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  37.76 
 
 
505 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  34.19 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  33.33 
 
 
510 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  23.53 
 
 
530 aa  79.7  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  30.41 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  31.94 
 
 
498 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  24.43 
 
 
331 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  27.73 
 
 
557 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  34.81 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  23.9 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  31.82 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  25.11 
 
 
635 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  25.11 
 
 
635 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  25.77 
 
 
555 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3976  hypothetical protein  23.3 
 
 
579 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.228372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0459  hypothetical protein  28.71 
 
 
343 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00698134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  24.41 
 
 
634 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>