60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0969 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1045    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  33.03 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  31.13 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  28.62 
 
 		 331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  28.32 
 
 		 557 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  26.43 
 
 		 512 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  30.45 
 
 		 498 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  28.9 
 
 		 527 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  28.93 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  24.84 
 
 		 530 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  29.73 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  27.27 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  32.89 
 
 		 670 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 673 aa  80.5  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  31.54 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  27.61 
 
 		 667 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3654  hypothetical protein  28.48 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.773483  hitchhiker  0.0000658966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.57 
 
 		 731 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2219  RNA-directed DNA polymerase  25.6 
 
 		 473 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  29.46 
 
 		 731 aa  50.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  28.57 
 
 		 727 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  29.92 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1252  group II intron-encoding maturase  24.76 
 
 		 473 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.811711  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1250  group II intron-encoding maturase  24.76 
 
 		 473 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1624  group II intron-encoding maturase  24.76 
 
 		 473 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817921  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1846  group II intron-encoding maturase  24.29 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0635  group II intron-encoding maturase  24.29 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3172  group II intron-encoding maturase  24.29 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3820  group II intron-encoding maturase  24.29 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.336915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3868  group II intron-encoding maturase  24.29 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6534  putative reverse transcriptasematurase of intron  21.78 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1245  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.75 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4614  putative recombinase  21.61 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179717  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.57 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000756298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.59 
 
 		 419 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  27.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  27.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  27.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  27.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  27.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  27.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3976  hypothetical protein  27.07 
 
 		 579 aa  44.3  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  27.84 
 
 		 553 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  23.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1201  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.14 
 
 		 420 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1421  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.14 
 
 		 420 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2085  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.14 
 
 		 420 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3163  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.14 
 
 		 420 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>