38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4255 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1142    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  30.48 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  28.22 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  27.52 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  33.57 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  31.13 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  26.73 
 
 		 527 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  25.16 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  27.27 
 
 		 543 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  23.5 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  34.81 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  32.09 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  30.15 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  33.1 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  32.81 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  29.89 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  25.16 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5396  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25.45 
 
 		 456 aa  47.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.476043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27540  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.82 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2008  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4399  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0288  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0269  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0904325 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0412624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1956  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00339995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3561  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3877  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2818  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281251  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3099  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5268  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.56 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0791  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.82 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0167  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.5 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2027  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.5 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0749  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.5 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  25.18 
 
 		 555 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0487  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.5 
 
 		 470 aa  43.9  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2224  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.5 
 
 		 470 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.321211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0829  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.5 
 
 		 470 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.880768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>