20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3026 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1367    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  41.86 
 
 		 670 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  32.14 
 
 		 673 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  30.58 
 
 		 667 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  24.52 
 
 		 543 aa  94.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  35 
 
 		 498 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  35.33 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  31.47 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  31.54 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  27.53 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  32.18 
 
 		 533 aa  77  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  29.74 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  32.09 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  31.03 
 
 		 505 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  28.28 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  29.2 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  31.62 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  25.17 
 
 		 492 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2099  hypothetical protein  28.23 
 
 		 545 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00838169  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  27.1 
 
 		 566 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>