More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4538 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4538  D-xylose-proton symporter  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  99.62 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  99.62 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  99.62 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  99.62 
 
 		 491 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  99.62 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  99.62 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  99.62 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  89.31 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  51.59 
 
 		 468 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  39.33 
 
 		 475 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  43.82 
 
 		 448 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  37.93 
 
 		 477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  38.37 
 
 		 485 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.08 
 
 		 480 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  39.45 
 
 		 442 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  37.93 
 
 		 492 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  37.93 
 
 		 492 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  37.45 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  37.93 
 
 		 492 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  38.43 
 
 		 468 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  39.92 
 
 		 450 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  32.34 
 
 		 478 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  37.64 
 
 		 474 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  35.94 
 
 		 499 aa  165  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  39.11 
 
 		 467 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  39.13 
 
 		 457 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  37.02 
 
 		 466 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.97 
 
 		 480 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  37.99 
 
 		 485 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  36.74 
 
 		 494 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  36.98 
 
 		 470 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.58 
 
 		 474 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  37.05 
 
 		 487 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  39.25 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  35.61 
 
 		 480 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  33.96 
 
 		 468 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  37.31 
 
 		 491 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  33.58 
 
 		 477 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  32.73 
 
 		 544 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  34.03 
 
 		 496 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  36.46 
 
 		 486 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  35.96 
 
 		 468 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  38.64 
 
 		 493 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  35.82 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  36.23 
 
 		 482 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  37.08 
 
 		 479 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  35.74 
 
 		 438 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  35.82 
 
 		 486 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.43 
 
 		 452 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.43 
 
 		 452 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  33.83 
 
 		 447 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  33.1 
 
 		 504 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  34.12 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  39.23 
 
 		 469 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.38 
 
 		 468 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.73 
 
 		 444 aa  141  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  31.6 
 
 		 441 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  34.33 
 
 		 479 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  36.6 
 
 		 497 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  34.22 
 
 		 475 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  34.93 
 
 		 437 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  34.09 
 
 		 480 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  34.47 
 
 		 479 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  32.65 
 
 		 443 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.07 
 
 		 475 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.29 
 
 		 516 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.33 
 
 		 463 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  29.34 
 
 		 507 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  31.2 
 
 		 458 aa  136  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.33 
 
 		 463 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  28.87 
 
 		 464 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  34.87 
 
 		 472 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.5 
 
 		 492 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  37.31 
 
 		 474 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  32.59 
 
 		 529 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  32.34 
 
 		 484 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.38 
 
 		 464 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.38 
 
 		 464 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.38 
 
 		 464 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.38 
 
 		 464 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.38 
 
 		 464 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  34.8 
 
 		 464 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  38.65 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.1 
 
 		 457 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  34.8 
 
 		 464 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  34.8 
 
 		 464 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  33.59 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  34.4 
 
 		 566 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.86 
 
 		 446 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.61 
 
 		 533 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03233  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14670)  38.76 
 
 		 517 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.2 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  30 
 
 		 445 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>