236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3139 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  60 
 
 		 299 aa  362  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  61.4 
 
 		 281 aa  345  7e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  41.64 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  40.13 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  41.69 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  40.39 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  40.78 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  39.81 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  40.97 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  40.07 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  41.29 
 
 		 337 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  38.82 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  39.41 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  38.92 
 
 		 338 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  42.47 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  39.03 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  39.94 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  39.35 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  39.74 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  38.96 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  38.57 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  37.37 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  37.99 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  38.98 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  38.06 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  39.05 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  37.74 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  36.13 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  38.73 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  33.44 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  34.62 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  34.29 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  34.3 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  37.28 
 
 		 332 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  33.98 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  33.76 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  32.99 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  32.99 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  36.52 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  32.65 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  34.59 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  35.07 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  35.07 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  35.07 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  33.68 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  34.78 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  36.05 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  32.87 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  35.62 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  35.07 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  35.64 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  34.03 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  34.72 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  33.9 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  34.38 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  33.9 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  34.03 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  34.03 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  34.03 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  35.09 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  34.26 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  34.26 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  34.26 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  34.26 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  33.68 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  32.52 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  30.82 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  30.56 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  30.21 
 
 		 281 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  30.21 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  31.49 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  33.45 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  34.6 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  32.17 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  30.93 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  33.45 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  34.95 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  34.38 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  32.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  32.19 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  30.82 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  31.83 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  32.44 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  32.06 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  32.75 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  31.77 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  32.66 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  32.11 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  31.94 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  31.94 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  32.11 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>