244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3895 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 		 289 aa  596  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  94.12 
 
 		 289 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  79.44 
 
 		 290 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  79.44 
 
 		 290 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  75.97 
 
 		 292 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  74.74 
 
 		 293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  74.74 
 
 		 293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  73.76 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 294 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 294 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 294 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  74.39 
 
 		 293 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  73.76 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 294 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  73.76 
 
 		 294 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  73.05 
 
 		 294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  73.4 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  73.4 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  73.4 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  71.63 
 
 		 292 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  72.7 
 
 		 294 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  58.39 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  60.87 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  58.04 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  58.7 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  58.42 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  55.94 
 
 		 286 aa  341  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  55.87 
 
 		 290 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  55.94 
 
 		 286 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  56.84 
 
 		 286 aa  339  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  55.59 
 
 		 286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  55.59 
 
 		 286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  56.64 
 
 		 288 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  55.91 
 
 		 286 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  55.91 
 
 		 286 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  54.48 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  54.48 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  54.48 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  54.48 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 286 aa  324  9e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 286 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  53.17 
 
 		 297 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  49.65 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  52.33 
 
 		 294 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  46.98 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  47.02 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  43.64 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  41.18 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  41.55 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  41.76 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  41.2 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  41.67 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  40.21 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  41.46 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  40.22 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  38.68 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  38.04 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  41.61 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  37.72 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  36.59 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  36.96 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  39.21 
 
 		 291 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  36.59 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  39.22 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  40.28 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  35.87 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  36.03 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  36.03 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  36.23 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  36.7 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  39.86 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  36.03 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  35.13 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  36.03 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  34.77 
 
 		 281 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  35.35 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  35.69 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  35.69 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  35.69 
 
 		 316 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  35.69 
 
 		 316 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  35.69 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  36.28 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  35.96 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  36.89 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  35.4 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  36.45 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  35.08 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01668  chaperonin HslO  35.94 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  35.2 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  35.18 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  36.81 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1649  Hsp33 protein  29.45 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>