242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4594 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  51.76 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  51.74 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  52.86 
 
 
291 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  53.07 
 
 
291 aa  298  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  51.06 
 
 
286 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  51.06 
 
 
286 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  50.18 
 
 
286 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  51.06 
 
 
286 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  51.06 
 
 
286 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  51.06 
 
 
286 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  51.06 
 
 
286 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  50.71 
 
 
286 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  50.17 
 
 
292 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  50 
 
 
286 aa  292  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  49.65 
 
 
291 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  51.09 
 
 
296 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  54.51 
 
 
286 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  49.29 
 
 
290 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  53.98 
 
 
286 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  48.76 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  49.3 
 
 
292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  48.41 
 
 
289 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  48.4 
 
 
290 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  46.88 
 
 
293 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  46.88 
 
 
293 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  46.98 
 
 
289 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  47.5 
 
 
290 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  46.53 
 
 
293 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  47.18 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
294 aa  270  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  47.18 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
294 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
294 aa  270  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
294 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  46.83 
 
 
294 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 
294 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  47.78 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  46.83 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  46.83 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  46.83 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  47.04 
 
 
297 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  46.48 
 
 
294 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  43.6 
 
 
299 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  46.45 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  44.77 
 
 
286 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  39.29 
 
 
297 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  40 
 
 
295 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  39.57 
 
 
284 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  35.19 
 
 
289 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  35.54 
 
 
289 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  36.79 
 
 
297 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  37.5 
 
 
297 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  33.92 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  36.76 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  36.4 
 
 
300 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  34.38 
 
 
281 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  35.66 
 
 
300 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  34.03 
 
 
281 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  32.99 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  34.51 
 
 
288 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  33.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  34.39 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  33.81 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  33.79 
 
 
316 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  32.44 
 
 
316 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  32.44 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.29 
 
 
299 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  32.11 
 
 
316 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  32.11 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  33.11 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  32.11 
 
 
316 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  34.15 
 
 
298 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  35.48 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  35.76 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  34.83 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  35.29 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  35.29 
 
 
299 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  32.2 
 
 
308 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  33.82 
 
 
299 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  34.19 
 
 
337 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  32.08 
 
 
316 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  32.08 
 
 
316 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  31.06 
 
 
316 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  34.08 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1094  Hsp33 protein  33.55 
 
 
333 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  33.23 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  33.33 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2069  Hsp33 protein  36.15 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  33.89 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  33.66 
 
 
330 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 
330 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>