235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1071 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  97.03 
 
 		 337 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  100 
 
 		 337 aa  698    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1132  putative redox regulated molecular chaperone heat-shock-like protein  85.8 
 
 		 338 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  71.94 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1094  Hsp33 protein  69.37 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  59.29 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  59.29 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  59.59 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  58.41 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  58.7 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  58.7 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  58.41 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  57.82 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  57.52 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  56.64 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  56.64 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  59.21 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  53.54 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  52.15 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0994  Hsp33 protein  53.19 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0909  Hsp33 protein  52.73 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3451  Hsp33 protein  51.52 
 
 		 335 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  52.6 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5111  Hsp33 protein  48.93 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1319  Hsp33 protein  49.54 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2652  Hsp33 protein  47.71 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2014  putative redox regulated molecular chaperone heat-shock-like protein  51.68 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0949  Hsp33 protein  45.83 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  43.79 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  40.65 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  41.84 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  41.12 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  43.48 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  38.27 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  37.42 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  41.54 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  37.76 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  40.36 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  39.5 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  36.79 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  41.74 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  39.29 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  38.81 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  40.65 
 
 		 299 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  40.36 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  38.24 
 
 		 286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  39.58 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  37.93 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  37.93 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  37.93 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  37.93 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  37.65 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  37.65 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  37.35 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  37.65 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  40.06 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  38.36 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  37.35 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  37.27 
 
 		 289 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  38.94 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  36.99 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  38.32 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  38.24 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  36.81 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  36.81 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  36.28 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  34.86 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  40.56 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  38.53 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  35.96 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  35.51 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  35.51 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  36.68 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  35.51 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  35.51 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  35.51 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  35.51 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  34.58 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  35.2 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  35.2 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  35.2 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  35.2 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  34.78 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  35.2 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  35.2 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  35.2 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  35.2 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  35.02 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  34.58 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  35.6 
 
 		 284 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  37.69 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  34.78 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  34.27 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  35.8 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.72943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>