244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3622 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  79.02 
 
 		 286 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  72.73 
 
 		 290 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  447  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  76.92 
 
 		 286 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  72.38 
 
 		 286 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  72.03 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  72.1 
 
 		 286 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  71.33 
 
 		 288 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  69.82 
 
 		 294 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  57.53 
 
 		 293 aa  347  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  57.53 
 
 		 293 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  57.19 
 
 		 293 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  57.99 
 
 		 292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  58.72 
 
 		 292 aa  341  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  58.33 
 
 		 294 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  58.33 
 
 		 294 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  58.33 
 
 		 294 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  57.64 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  57.64 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 294 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 294 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 294 aa  340  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 294 aa  340  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  56.84 
 
 		 289 aa  339  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  57.99 
 
 		 294 aa  338  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  57.99 
 
 		 294 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  55.71 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  56.94 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  55.79 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  55.94 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  55.48 
 
 		 291 aa  332  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  56.49 
 
 		 290 aa  324  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  53.87 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  54.42 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  50.71 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  50.7 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  49.46 
 
 		 286 aa  285  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  49.46 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  45.8 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  47.18 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  46.83 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  46.48 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  45.65 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  44.48 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  45.71 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  47.27 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  45.55 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  45.71 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  43.06 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  44.29 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  45.1 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  43.93 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  43.21 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  39.93 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  42.86 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  43.73 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  43.97 
 
 		 291 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  40.34 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  38.81 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  40.07 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  39.06 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  38.89 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  37.79 
 
 		 316 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  38.56 
 
 		 316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  40.33 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  39.39 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  38.56 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  38.56 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  39.39 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  38.56 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  38.05 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  40 
 
 		 322 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  37.99 
 
 		 281 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  37.63 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  38.8 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  40.86 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  41.88 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  37.5 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  37.41 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  37.83 
 
 		 326 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  38.36 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2652  Hsp33 protein  37.7 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  37.74 
 
 		 337 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0909  Hsp33 protein  38.29 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>