244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3770 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
294 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
294 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
294 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  99.32 
 
 
294 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  99.32 
 
 
294 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  93.2 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  93.2 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  93.2 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  93.2 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  93.15 
 
 
292 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  93.15 
 
 
292 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  93.15 
 
 
292 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  92.52 
 
 
294 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  93.15 
 
 
292 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  87.33 
 
 
292 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  71.92 
 
 
292 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  73.4 
 
 
289 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  73.05 
 
 
289 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  70.31 
 
 
293 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  70.31 
 
 
293 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  69.97 
 
 
293 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  70.21 
 
 
290 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  71.99 
 
 
290 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  57.44 
 
 
291 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  59.93 
 
 
286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  58.1 
 
 
290 aa  350  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  59.23 
 
 
286 aa  350  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  57.09 
 
 
296 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  59.72 
 
 
286 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  58.89 
 
 
286 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  58.89 
 
 
286 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  56.64 
 
 
291 aa  346  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 
288 aa  342  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  59.57 
 
 
286 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  58.33 
 
 
286 aa  341  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 
286 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 
286 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 
286 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 
286 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  55.94 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 
286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  58.42 
 
 
286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  53.41 
 
 
286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  55.24 
 
 
294 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  51.89 
 
 
297 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  49.45 
 
 
286 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  47.08 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  46.83 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  41.44 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  41.07 
 
 
289 aa  234  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  41.3 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  41.52 
 
 
289 aa  232  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  42.81 
 
 
284 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  41.55 
 
 
297 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  41.22 
 
 
297 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  43.46 
 
 
288 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  39.73 
 
 
300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  38.93 
 
 
297 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  38.05 
 
 
300 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  37.71 
 
 
300 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  39.67 
 
 
296 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  38.81 
 
 
297 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  37.5 
 
 
299 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  37.5 
 
 
299 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  37.5 
 
 
299 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  38.49 
 
 
294 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  36.24 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  40.28 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  35.85 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  36.48 
 
 
316 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  41.43 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  35.85 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  35.85 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  35.53 
 
 
316 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  35.22 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  37.01 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  35.53 
 
 
316 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  35.22 
 
 
316 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  35.22 
 
 
316 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  34.28 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  36.77 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  36.94 
 
 
334 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  36.14 
 
 
337 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  34.28 
 
 
316 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1319  Hsp33 protein  35.28 
 
 
336 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  33.1 
 
 
281 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  37.42 
 
 
339 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  35.51 
 
 
337 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  35.26 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  35.85 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0909  Hsp33 protein  35.87 
 
 
335 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0994  Hsp33 protein  35.87 
 
 
335 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1094  Hsp33 protein  36.91 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>