236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0994 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0909  Hsp33 protein  98.51 
 
 
335 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0994  Hsp33 protein  100 
 
 
335 aa  688    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1319  Hsp33 protein  80.61 
 
 
336 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5111  Hsp33 protein  74.85 
 
 
330 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.950978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3451  Hsp33 protein  72.54 
 
 
335 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2652  Hsp33 protein  67.48 
 
 
329 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  69.6 
 
 
322 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  68.81 
 
 
322 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2014  putative redox regulated molecular chaperone heat-shock-like protein  70.12 
 
 
321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  68.24 
 
 
339 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  53.19 
 
 
337 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  50 
 
 
316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  52.73 
 
 
337 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  48.12 
 
 
316 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  47.96 
 
 
316 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  47.96 
 
 
316 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  47.95 
 
 
316 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  47.96 
 
 
316 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  47.95 
 
 
316 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  47.65 
 
 
316 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  46.39 
 
 
316 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  47.65 
 
 
316 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1094  Hsp33 protein  51.08 
 
 
333 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  45.77 
 
 
316 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1132  putative redox regulated molecular chaperone heat-shock-like protein  50.45 
 
 
338 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  50.93 
 
 
334 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  47.45 
 
 
308 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0949  Hsp33 protein  40.36 
 
 
321 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  43.13 
 
 
293 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  43.12 
 
 
298 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  38.08 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  39.82 
 
 
294 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  38.29 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  37.35 
 
 
300 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  37.7 
 
 
288 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  42.2 
 
 
288 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  37.94 
 
 
286 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  39.51 
 
 
297 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
292 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  36.19 
 
 
292 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
294 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
294 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
292 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
294 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  36.19 
 
 
292 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
294 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  39.2 
 
 
297 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  34.5 
 
 
290 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  36.74 
 
 
286 aa  185  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  35.56 
 
 
294 aa  185  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  34.88 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  38.58 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  37.38 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  35.56 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  37.7 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  35.87 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  35.87 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  35.87 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  38.77 
 
 
295 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  35.87 
 
 
294 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  38.15 
 
 
300 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  36.1 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  36.1 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  36.1 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  36.1 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  34.98 
 
 
289 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  34.06 
 
 
291 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  37.54 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  36.56 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  35.46 
 
 
286 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  33.75 
 
 
292 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  35.46 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  35.46 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  35.14 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  35.14 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  34.08 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  35.02 
 
 
293 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  33.44 
 
 
286 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  35.02 
 
 
293 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  34.7 
 
 
293 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  34.29 
 
 
290 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  36.2 
 
 
291 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  33.65 
 
 
296 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  36.42 
 
 
294 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  32.7 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  33.12 
 
 
289 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  36.74 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  38.89 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  32.38 
 
 
291 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  31.83 
 
 
289 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.14 
 
 
299 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  36.1 
 
 
299 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  31.19 
 
 
281 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  35.78 
 
 
299 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>