243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4361 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  87.76 
 
 		 286 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  79.02 
 
 		 286 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  77.27 
 
 		 290 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  73.78 
 
 		 286 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  74.13 
 
 		 286 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  73.78 
 
 		 286 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  73.78 
 
 		 286 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  74.13 
 
 		 286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  74.13 
 
 		 286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  74.13 
 
 		 286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  74.13 
 
 		 286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  72.38 
 
 		 286 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  71.74 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  69.23 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  71.33 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  59.64 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  56.9 
 
 		 293 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  56.9 
 
 		 293 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  56.55 
 
 		 293 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  58.42 
 
 		 289 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  58.5 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 289 aa  341  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  58.42 
 
 		 292 aa  338  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  56.14 
 
 		 290 aa  338  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  57.71 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  57.71 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  57.5 
 
 		 292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  55.79 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  57.35 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  57.35 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  57.35 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  57.35 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  57.35 
 
 		 292 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  57.35 
 
 		 292 aa  335  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  57.35 
 
 		 292 aa  335  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  57.35 
 
 		 292 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  57.91 
 
 		 290 aa  335  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  54.67 
 
 		 291 aa  331  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  56.63 
 
 		 294 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  55.79 
 
 		 291 aa  328  9e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  53.71 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  54.51 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  48.41 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  48.56 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  44.77 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  42.61 
 
 		 289 aa  259  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  44.79 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  44.71 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  44.67 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  43.97 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  45 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  42.81 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  41.67 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  42.61 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  43.97 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  44.95 
 
 		 294 aa  245  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  43.97 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  42.35 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  41.99 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  43.05 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  41.99 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  41.64 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  40.13 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  42.18 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  42.21 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  40 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  38.54 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  39.14 
 
 		 316 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  39.14 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  38.46 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  38.21 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  38.46 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  38.91 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  38.46 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  38.73 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  37.82 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  38.56 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  37.71 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  37.71 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  39.22 
 
 		 339 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  41.37 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  37.77 
 
 		 281 aa  205  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  37.41 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  38.85 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1319  Hsp33 protein  36.64 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2014  putative redox regulated molecular chaperone heat-shock-like protein  38.73 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  36.77 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5111  Hsp33 protein  36.19 
 
 		 330 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950978 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  36.45 
 
 		 326 aa  191  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2652  Hsp33 protein  37.18 
 
 		 329 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>