242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03953 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
299 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  65.08 
 
 
297 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  50.85 
 
 
286 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  50.85 
 
 
286 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  50.85 
 
 
286 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  50.85 
 
 
286 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  51.21 
 
 
286 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  51.21 
 
 
286 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  50.88 
 
 
290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  50.87 
 
 
286 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  50.52 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  52.61 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  49.49 
 
 
288 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  53.71 
 
 
286 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  50.7 
 
 
286 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  48.24 
 
 
286 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  52.65 
 
 
286 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  49.13 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  47.4 
 
 
292 aa  279  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  48.57 
 
 
291 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  47.7 
 
 
289 aa  275  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  46.39 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  47.08 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  47.08 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  47.08 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  45.99 
 
 
290 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  47.02 
 
 
289 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  46.74 
 
 
294 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  45.21 
 
 
293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  46.39 
 
 
294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  45.21 
 
 
293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  44.79 
 
 
290 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  45.39 
 
 
291 aa  266  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  44.86 
 
 
293 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  44.98 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  44.98 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  44.98 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  44.98 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  44.98 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  44.98 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  44.98 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  44.98 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  44.72 
 
 
296 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  45.04 
 
 
291 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  44.29 
 
 
294 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  43.6 
 
 
290 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  44.44 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  41.7 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  39.79 
 
 
289 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  39.86 
 
 
284 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  39.52 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  39.86 
 
 
297 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  38.68 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  39.38 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  37.84 
 
 
300 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  39.18 
 
 
297 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  39.52 
 
 
300 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  39.8 
 
 
300 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  37.41 
 
 
291 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  37.21 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  39.79 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  36.88 
 
 
299 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  40.07 
 
 
294 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  36.21 
 
 
299 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.96 
 
 
299 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  38.78 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  38.14 
 
 
298 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  35.34 
 
 
291 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  36.45 
 
 
317 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  36.14 
 
 
293 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  33.22 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  32.87 
 
 
281 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  32.64 
 
 
297 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  34.73 
 
 
326 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  34.41 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01668  chaperonin HslO  36.08 
 
 
296 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  33.22 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  33.22 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  32.89 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  33.22 
 
 
316 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  32.89 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  32.23 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  32.89 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  32.21 
 
 
316 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  34.08 
 
 
322 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  35.28 
 
 
322 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3059  Hsp33 protein  36.08 
 
 
297 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.387428  normal  0.813852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  32.21 
 
 
316 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2069  Hsp33 protein  33.88 
 
 
309 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  32.21 
 
 
316 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  31.88 
 
 
316 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  32.2 
 
 
308 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0949  Hsp33 protein  32.79 
 
 
321 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2652  Hsp33 protein  32.83 
 
 
329 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>