234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1357 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  61.68 
 
 
299 aa  347  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  61.4 
 
 
304 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  42.37 
 
 
347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  40.27 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  44.21 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
335 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
335 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  41.64 
 
 
325 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  41.18 
 
 
335 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  41.86 
 
 
342 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  41.03 
 
 
340 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  41.02 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  40.14 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  42.05 
 
 
331 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  41.81 
 
 
334 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  41.75 
 
 
332 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  41.61 
 
 
337 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  41.03 
 
 
329 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  42.47 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  40.62 
 
 
335 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  39.93 
 
 
331 aa  178  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  43.66 
 
 
291 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  41.81 
 
 
330 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  40.56 
 
 
351 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  39.93 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  38.99 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  39.52 
 
 
338 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  37.32 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  37.54 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  39.64 
 
 
311 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  38.06 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  38.06 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  37.69 
 
 
293 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  35.17 
 
 
332 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  38.28 
 
 
320 aa  148  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  33.68 
 
 
325 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  34.2 
 
 
329 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  38.85 
 
 
332 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  32.76 
 
 
341 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  34.01 
 
 
333 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  32.9 
 
 
329 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  32.9 
 
 
329 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  39.47 
 
 
288 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  35.42 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  35.06 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  35.42 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  35.16 
 
 
289 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  35.69 
 
 
292 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  35.04 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  34.53 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  34.53 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  34.53 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  34.53 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  35.93 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  35.4 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  36.19 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  33.81 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  33.58 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  32.47 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  35.45 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  34.32 
 
 
294 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  34.32 
 
 
294 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 
286 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  34.32 
 
 
294 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  34.32 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  32.97 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  33.57 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  32.73 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  33.95 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  32.73 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  32.61 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  34.89 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  33.09 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  33.09 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  35.04 
 
 
297 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  34.47 
 
 
290 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  30.18 
 
 
281 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  30.18 
 
 
281 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  33.33 
 
 
291 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  34.57 
 
 
299 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  31.41 
 
 
296 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  33.57 
 
 
286 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  32.37 
 
 
291 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  34.57 
 
 
286 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  32.84 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  36.8 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  34.67 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  34.2 
 
 
299 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  33.33 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  36.4 
 
 
298 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  33.83 
 
 
299 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  30.8 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  33.83 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>