238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0478 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  75.6 
 
 		 330 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  76.21 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  70.59 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  65.52 
 
 		 342 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  65.74 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  64.71 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  53.98 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  54.51 
 
 		 334 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  52.92 
 
 		 344 aa  308  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  52.98 
 
 		 335 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  54.79 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  54.79 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  54.79 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  52.54 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  52.4 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  53.06 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  53.24 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  52.41 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  50.69 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  51.74 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  50.34 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  49.65 
 
 		 351 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  48.26 
 
 		 351 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  45.67 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  41.24 
 
 		 309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  44.83 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  37 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  39.12 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  43.66 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  37.88 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  41.34 
 
 		 311 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  37.72 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  36.08 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  35.64 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  35.64 
 
 		 329 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  37.07 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  36.43 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  40.69 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  37.11 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  34.49 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  33.45 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  31.14 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  32.87 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  33.45 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  30.8 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  33.45 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  32.99 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  33.45 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  33.57 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  34.15 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  34.62 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  32.52 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  35.17 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  32.88 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  32.87 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  35.27 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  35.27 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  35.27 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  34.93 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  32.87 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  34.14 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  34.14 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  32.99 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  32.87 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  35.19 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  32.87 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  32.53 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  33.45 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  33.56 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  32.32 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  33.79 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  31.93 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  33.56 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  31.71 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  33.56 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  32.52 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  32.32 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  33.22 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  31.93 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  33 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  32.76 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  32.52 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  31.4 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  33.56 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  32.4 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>