238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0761 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
331 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  80.3 
 
 
337 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  78.68 
 
 
335 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  81.33 
 
 
351 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  77.11 
 
 
332 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  76.28 
 
 
334 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  81.33 
 
 
351 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  62.54 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  64.03 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  61.73 
 
 
335 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  61.73 
 
 
335 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  61.73 
 
 
335 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  60.83 
 
 
347 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  59.05 
 
 
337 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  57.83 
 
 
336 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  56.92 
 
 
325 aa  363  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  52.69 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  55.77 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  54.84 
 
 
338 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  54.81 
 
 
330 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  53.85 
 
 
342 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  52.24 
 
 
330 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  49.21 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  45.45 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  45.98 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  51.74 
 
 
291 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  45.86 
 
 
305 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  42.32 
 
 
333 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  41.18 
 
 
332 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  39.43 
 
 
325 aa  222  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  38.01 
 
 
341 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  36.11 
 
 
329 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  35.87 
 
 
329 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  41.39 
 
 
332 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  35.8 
 
 
329 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  41.64 
 
 
304 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  36.96 
 
 
311 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  37.99 
 
 
320 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  39.03 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  42.05 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  37.5 
 
 
295 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.08 
 
 
299 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  37.24 
 
 
300 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  33.22 
 
 
286 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 
286 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  37.15 
 
 
300 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  34.75 
 
 
299 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  34.85 
 
 
299 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  34.43 
 
 
299 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  37.15 
 
 
297 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
297 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  33.56 
 
 
292 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  34.38 
 
 
300 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  32.75 
 
 
286 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  33.92 
 
 
297 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  31.35 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  31.35 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  34.52 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  31.35 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  31.35 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  33.45 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  31.35 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  31.35 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  31.35 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  31.35 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  31.02 
 
 
294 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  31.47 
 
 
290 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  32.66 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  33.57 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  35.57 
 
 
288 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  33.1 
 
 
296 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  34.88 
 
 
291 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  32.99 
 
 
291 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  31.49 
 
 
286 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  31.65 
 
 
290 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  31.49 
 
 
288 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  33.55 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  33.77 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  32.06 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  31.58 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  31.48 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  31.83 
 
 
286 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  29.53 
 
 
281 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  31.99 
 
 
291 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  32.18 
 
 
286 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  32.18 
 
 
286 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  32.4 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  30.82 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  30.82 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  30.82 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  31.83 
 
 
286 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  32.87 
 
 
293 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  29.19 
 
 
281 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  31.49 
 
 
286 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  30.31 
 
 
290 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  30.87 
 
 
294 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  31.49 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>