242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1971 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  93.13 
 
 
335 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  93.43 
 
 
335 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 
335 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  80.31 
 
 
347 aa  507  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  76.45 
 
 
336 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  72.46 
 
 
337 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  65.18 
 
 
325 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  65.27 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  61.73 
 
 
331 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  62.94 
 
 
344 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  61.35 
 
 
334 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  59.32 
 
 
337 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  59.76 
 
 
335 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  57.94 
 
 
340 aa  362  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  58.54 
 
 
342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  58.05 
 
 
351 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  57.1 
 
 
351 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  57.45 
 
 
332 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  54.69 
 
 
338 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  55.28 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  54.09 
 
 
330 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  54.57 
 
 
330 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  44.94 
 
 
329 aa  278  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  52.36 
 
 
291 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  45 
 
 
331 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  42.9 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  44.16 
 
 
309 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  40.51 
 
 
325 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  38.61 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  38.92 
 
 
329 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  38.92 
 
 
329 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  38.91 
 
 
333 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  38.77 
 
 
341 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  38.79 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  39.68 
 
 
320 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  38.46 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  40.13 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  41.52 
 
 
281 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  40.58 
 
 
299 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  38.24 
 
 
332 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  33.02 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  33.64 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.92 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  36.66 
 
 
297 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  36.33 
 
 
297 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  32.19 
 
 
290 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 
296 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  32.58 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  34.41 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  31.83 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  33.12 
 
 
292 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  35.92 
 
 
299 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  30.97 
 
 
291 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  36.45 
 
 
288 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  35.28 
 
 
299 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 
291 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  31.94 
 
 
292 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  33.87 
 
 
300 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  33.98 
 
 
300 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  34.73 
 
 
299 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  30.1 
 
 
289 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  33.44 
 
 
300 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  30 
 
 
290 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
288 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  35.49 
 
 
296 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  30.94 
 
 
286 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  31.29 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  31.29 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  31.29 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  31.29 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  33.11 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  30.65 
 
 
286 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  30.42 
 
 
281 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  30.45 
 
 
286 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  30.97 
 
 
286 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  30.97 
 
 
286 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  32.08 
 
 
294 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  29.49 
 
 
286 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  32.36 
 
 
286 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  34.63 
 
 
298 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  32.04 
 
 
286 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  32.58 
 
 
289 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  30.1 
 
 
281 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  29.68 
 
 
289 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  31.41 
 
 
284 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  28.95 
 
 
294 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  28.95 
 
 
294 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  28.95 
 
 
294 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  28.95 
 
 
294 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  28.8 
 
 
292 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  28.8 
 
 
292 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  28.8 
 
 
292 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  28.8 
 
 
292 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  32.92 
 
 
316 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  32.93 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  32.6 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  34.18 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  33.66 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  32.31 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  32.6 
 
 
316 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>