240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0404 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  100 
 
 
331 aa  674    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  49.21 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  47.04 
 
 
335 aa  305  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  48.1 
 
 
338 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  46.3 
 
 
334 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  45.08 
 
 
329 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  48.26 
 
 
332 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  48.44 
 
 
351 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  46.73 
 
 
351 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  47.28 
 
 
344 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  46.88 
 
 
337 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  46.18 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  47.6 
 
 
330 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  46.79 
 
 
342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  46.01 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  47.6 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  46.88 
 
 
337 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  48.25 
 
 
325 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  48.1 
 
 
325 aa  279  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  46.18 
 
 
347 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  47.5 
 
 
336 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  44.38 
 
 
335 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  44.38 
 
 
335 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  48.85 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  45 
 
 
335 aa  268  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  45.45 
 
 
309 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  45.78 
 
 
332 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  44.44 
 
 
291 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  41.82 
 
 
325 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  42.57 
 
 
320 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  39.63 
 
 
332 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  39.32 
 
 
329 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  38.7 
 
 
329 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  38.7 
 
 
329 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  37.2 
 
 
333 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  36.76 
 
 
341 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  38.56 
 
 
311 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  39.74 
 
 
304 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  39.93 
 
 
281 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  38.61 
 
 
299 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  37 
 
 
289 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  39.6 
 
 
298 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  36.57 
 
 
295 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  37.87 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  38.61 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.39 
 
 
299 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  34.19 
 
 
291 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  34.74 
 
 
291 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  36.27 
 
 
299 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  36.54 
 
 
297 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  34.42 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  34.42 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  33.44 
 
 
291 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  33.66 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  35.83 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  32.67 
 
 
286 aa  165  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 
289 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  35.88 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  35.55 
 
 
297 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  35.67 
 
 
289 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  32.37 
 
 
292 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  32.46 
 
 
290 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  31.7 
 
 
289 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  31.6 
 
 
290 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  31.86 
 
 
290 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
292 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  30.32 
 
 
292 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
294 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
292 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
294 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
294 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
294 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  38.08 
 
 
288 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  30 
 
 
294 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  30.77 
 
 
294 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
294 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  30.45 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  30.45 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  30.45 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  32.36 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  32 
 
 
292 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  34.1 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  32.89 
 
 
286 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  32.89 
 
 
286 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  30.69 
 
 
286 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  32.5 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  32.7 
 
 
316 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1408  33 kDa chaperonin  34.2 
 
 
280 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  32.45 
 
 
288 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1131  Hsp33 protein  34.2 
 
 
280 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  35.06 
 
 
284 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  32.78 
 
 
286 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  32.45 
 
 
286 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>