239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1131 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1131  Hsp33 protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1408  33 kDa chaperonin  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  39.51 
 
 
295 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  38.33 
 
 
297 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  38.65 
 
 
288 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  35.84 
 
 
289 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  37.41 
 
 
297 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  36.11 
 
 
294 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  34.2 
 
 
331 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  36.46 
 
 
297 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  34.84 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  35.31 
 
 
300 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  37.41 
 
 
300 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  31.9 
 
 
291 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  36.24 
 
 
299 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.42 
 
 
299 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  35.76 
 
 
299 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  34.66 
 
 
289 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3059  Hsp33 protein  40.3 
 
 
297 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.387428  normal  0.813852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  34.97 
 
 
299 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01668  chaperonin HslO  36.9 
 
 
296 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  34.01 
 
 
291 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  31.65 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  31.23 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  32.75 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  31.58 
 
 
296 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  34.63 
 
 
305 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  32.39 
 
 
286 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  32.39 
 
 
286 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  32.51 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  32.27 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  33.33 
 
 
291 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  32.86 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  31.83 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  34.98 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  32.16 
 
 
286 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  32.16 
 
 
286 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  32.16 
 
 
286 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  32.16 
 
 
286 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  30.88 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  29.9 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  30 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  33.44 
 
 
351 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  33.68 
 
 
284 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  30.66 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  33.45 
 
 
337 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  32.34 
 
 
351 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  30.55 
 
 
290 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  31.54 
 
 
286 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  30.35 
 
 
347 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  34.68 
 
 
334 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 
288 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  32.76 
 
 
331 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  31.88 
 
 
290 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  30.53 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  31.46 
 
 
316 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1240  heat shock protein HSP33  32.76 
 
 
286 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  30.69 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  33.58 
 
 
293 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  33.58 
 
 
293 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  32.89 
 
 
335 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  30.69 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  30.49 
 
 
316 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  31.6 
 
 
330 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  31.48 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1148  Hsp33 protein  32.07 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.279106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  30.36 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  30.69 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  33.21 
 
 
293 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  30.69 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  32.97 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2037  Hsp33 protein  30.71 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  30.82 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  30.69 
 
 
316 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  31.86 
 
 
332 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  32.07 
 
 
296 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  32.59 
 
 
334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  26.71 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  26.71 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  30.04 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  30.07 
 
 
338 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  29.86 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  28.11 
 
 
286 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  29.7 
 
 
316 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  30.61 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  29.7 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  31.17 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  30.07 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1094  Hsp33 protein  31.51 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  31.29 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  29.73 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  30.07 
 
 
335 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  30.32 
 
 
286 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>