231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1207 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  100 
 
 		 329 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  99.7 
 
 		 329 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  96.05 
 
 		 329 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  72.36 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  66.77 
 
 		 325 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  66.46 
 
 		 333 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  60.79 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  38.63 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  38.27 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  38.92 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  38.92 
 
 		 335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  38.61 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  39.25 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  39.14 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  38.23 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  38.6 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  38.48 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  36.16 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  37.07 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  38.41 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  39.09 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  37.15 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  36.7 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  36.67 
 
 		 342 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  36.76 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  36.7 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  36.34 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  36.39 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  36 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  34.85 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  34.44 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  34.57 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  35.37 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  36.05 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  34.95 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  32.69 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  33.23 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  34.29 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  32.37 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  34.87 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  33.12 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  33.99 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  34.09 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  34.2 
 
 		 281 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  32.7 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  31.11 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  32.7 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  34.26 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  26.8 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  29.07 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  28.8 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  26.63 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  28.48 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  27.6 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  30.45 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  27.6 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  32.25 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  26.8 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  30.07 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  28.99 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  28.75 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  32.72 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  33.54 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  27.27 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  28.66 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  30.65 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  29.13 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  28.43 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  26.67 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  31.49 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  30.62 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  29.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  27.67 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  27.21 
 
 		 294 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  27.21 
 
 		 294 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  27.21 
 
 		 294 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  26.87 
 
 		 294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  30.41 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  29.34 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  30.84 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  32.69 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  29.43 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  26.87 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  26.53 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  29.85 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  26.53 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  26.47 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  26.53 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>