95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1739 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1739  CheW protein  100 
 
 		 145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0396744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0066  CheW protein  43.88 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  31.06 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  25.37 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.71 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.81 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.73 
 
 		 164 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.72 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.74 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.73 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  24.75 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.93 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.88 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.93 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.85 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  31.94 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  34.69 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.33 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  26.47 
 
 		 479 aa  47.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  25.6 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.82 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.82 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.93 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  34.33 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  31.07 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.79 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.13 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.94 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.94 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.94 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  34.92 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  23.31 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  30.88 
 
 		 528 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  29.47 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  24.82 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.17 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  27.43 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  27.43 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.13 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  26.13 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  33.33 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  28.42 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.03 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  29.21 
 
 		 325 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  29.57 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  29.57 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  23.08 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  25.93 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  26.72 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  28.35 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  24.82 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  28.7 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  24 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  27.08 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  22.83 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  30.12 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  33.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  25.36 
 
 		 531 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  24.75 
 
 		 176 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  24.82 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  24.82 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  20.83 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  28.7 
 
 		 156 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  28.83 
 
 		 164 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  26.04 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  27.82 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  27.94 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  23.81 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  26.47 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  27.54 
 
 		 568 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  24.36 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.09 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.81 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1832  CheW protein  32.79 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0194575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  31.58 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  31.03 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  26.5 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  27.72 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  26.36 
 
 		 262 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  37.62 
 
 		 147 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.18 
 
 		 148 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  23.77 
 
 		 163 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>