55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1102 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1035    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  30.66 
 
 		 571 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  32.91 
 
 		 554 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  31.07 
 
 		 576 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  33.76 
 
 		 543 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  29.36 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  28.22 
 
 		 602 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  29.72 
 
 		 602 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  29.72 
 
 		 602 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  29.55 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  29.55 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  29.55 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  29.55 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  29.57 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  25.46 
 
 		 589 aa  97.4  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  26.04 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  27.55 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  26.13 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  27.58 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  24.87 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  24.87 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  27.5 
 
 		 552 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  27.5 
 
 		 552 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  28.18 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  27.68 
 
 		 598 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  24.48 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  24.48 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  27.88 
 
 		 563 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  28.39 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  28.39 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  28.39 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  27.89 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  28.18 
 
 		 597 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  27.77 
 
 		 740 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  29.27 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  24.67 
 
 		 603 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  23.37 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  25.45 
 
 		 672 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  25.84 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  24.18 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  26.5 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  27.64 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  24.73 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  24.54 
 
 		 621 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  44.83 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  27.4 
 
 		 603 aa  50.4  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  34.15 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  29.95 
 
 		 648 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  40.91 
 
 		 427 aa  47  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  35.66 
 
 		 762 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  48 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  29.14 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>