62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0355 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  99.52 
 
 
649 aa  1210    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1219    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  91.47 
 
 
598 aa  992    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1219    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1219    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  99.52 
 
 
740 aa  1210    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  99.52 
 
 
649 aa  1211    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  99.83 
 
 
597 aa  1163    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  51.76 
 
 
602 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  51.93 
 
 
602 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  51.76 
 
 
602 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  51.76 
 
 
602 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  51.07 
 
 
602 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  51.76 
 
 
602 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  51.93 
 
 
602 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  51.65 
 
 
568 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  46.12 
 
 
603 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  46.12 
 
 
603 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  44.73 
 
 
608 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  42.05 
 
 
626 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  43.93 
 
 
603 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  39.68 
 
 
595 aa  287  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  37.66 
 
 
621 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  39.87 
 
 
596 aa  280  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  34.7 
 
 
589 aa  277  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  34.1 
 
 
596 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  34.1 
 
 
590 aa  217  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  37.26 
 
 
552 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  37.26 
 
 
552 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  33.16 
 
 
541 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  29.34 
 
 
648 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  30.69 
 
 
563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  29.74 
 
 
556 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  27.91 
 
 
556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  29.11 
 
 
575 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  28.79 
 
 
678 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  29.4 
 
 
762 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  25.6 
 
 
571 aa  90.5  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  29.73 
 
 
542 aa  90.5  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  28.73 
 
 
672 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  29.18 
 
 
717 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  25.78 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  28.08 
 
 
659 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  28.34 
 
 
603 aa  77  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  29.3 
 
 
604 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  27.88 
 
 
576 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  28.21 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  28.88 
 
 
546 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  27.86 
 
 
566 aa  64.3  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  26.65 
 
 
651 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  25.96 
 
 
573 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  26.3 
 
 
543 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  41.18 
 
 
423 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  41.18 
 
 
423 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  41.18 
 
 
423 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  39.08 
 
 
423 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  37.93 
 
 
423 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  34.34 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  36.78 
 
 
423 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  27.38 
 
 
424 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  46.15 
 
 
418 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  40.96 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>