51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1283 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1093    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1095    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1093    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  99.65 
 
 
602 aa  1091    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  99.65 
 
 
602 aa  1091    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  99.82 
 
 
602 aa  1092    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  92.08 
 
 
602 aa  972    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1093    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  51.92 
 
 
626 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  52.7 
 
 
598 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  51.23 
 
 
649 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  51.23 
 
 
649 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  51.05 
 
 
620 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  51.05 
 
 
620 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  51.05 
 
 
620 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  51.05 
 
 
740 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  50.88 
 
 
597 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  48.05 
 
 
603 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  48.05 
 
 
603 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  48.41 
 
 
608 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  46.11 
 
 
603 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  42.55 
 
 
621 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  42.12 
 
 
595 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  40.94 
 
 
596 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  35.19 
 
 
589 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  35.4 
 
 
552 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  35.4 
 
 
552 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  32.72 
 
 
596 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  32.72 
 
 
590 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  40.76 
 
 
541 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  30.16 
 
 
648 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  31.44 
 
 
556 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  31.27 
 
 
556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  31.46 
 
 
563 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  30.92 
 
 
717 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  26.5 
 
 
571 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  27.65 
 
 
575 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  28.5 
 
 
542 aa  97.4  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  29.01 
 
 
762 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  29.5 
 
 
603 aa  88.2  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  29.76 
 
 
678 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  29.32 
 
 
542 aa  84  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  29.67 
 
 
672 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  31.23 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  29.22 
 
 
604 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  29.37 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  28.3 
 
 
576 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  27.15 
 
 
554 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  28.18 
 
 
659 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  28.89 
 
 
651 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  23.45 
 
 
573 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>