58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2155 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1144    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  40.52 
 
 
556 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  35.15 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  34.98 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  30.69 
 
 
590 aa  140  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  30.69 
 
 
596 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  30.08 
 
 
604 aa  137  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 
659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  28.18 
 
 
589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  30.06 
 
 
602 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  30.06 
 
 
602 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  30.06 
 
 
602 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  29.3 
 
 
608 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  30.06 
 
 
602 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  27.71 
 
 
626 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  35.4 
 
 
651 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  29.15 
 
 
603 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  29.15 
 
 
603 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  29.91 
 
 
602 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  29.75 
 
 
602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  31.39 
 
 
678 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  30.02 
 
 
568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  31.08 
 
 
541 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  28.23 
 
 
602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  29.79 
 
 
672 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  30.52 
 
 
595 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  35.05 
 
 
552 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  35.05 
 
 
552 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  30.11 
 
 
603 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  29.4 
 
 
563 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  28.64 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  26.79 
 
 
621 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  27.31 
 
 
648 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  27.11 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 
596 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  27.39 
 
 
649 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  27.23 
 
 
649 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  27.46 
 
 
620 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  27.46 
 
 
620 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  26.5 
 
 
571 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  27.46 
 
 
620 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  27.46 
 
 
740 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  27.08 
 
 
597 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  26.24 
 
 
717 aa  65.1  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  27.27 
 
 
542 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  25.79 
 
 
554 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.86 
 
 
424 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  26.9 
 
 
566 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  26.77 
 
 
762 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  26.97 
 
 
573 aa  50.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  48.21 
 
 
434 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  48.98 
 
 
423 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  48.98 
 
 
423 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  25.95 
 
 
543 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  48.98 
 
 
423 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  48.98 
 
 
423 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  44.44 
 
 
418 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  46.94 
 
 
423 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>