43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1450 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1245    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  32.69 
 
 
626 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  32.99 
 
 
603 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  32.99 
 
 
603 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  32.89 
 
 
608 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  37.76 
 
 
603 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  32.9 
 
 
621 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  31.87 
 
 
595 aa  187  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  31 
 
 
602 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  31 
 
 
602 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  30.86 
 
 
602 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  30.86 
 
 
602 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  30.86 
 
 
602 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  30.86 
 
 
602 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  31.83 
 
 
602 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  30.5 
 
 
568 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 
596 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  27.79 
 
 
589 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  30.31 
 
 
598 aa  143  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  28.77 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  28.92 
 
 
740 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  28.61 
 
 
649 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  27.71 
 
 
597 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  27.71 
 
 
620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  27.71 
 
 
620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  27.71 
 
 
620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  27.16 
 
 
590 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  27.16 
 
 
596 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  27.04 
 
 
552 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  27.04 
 
 
552 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  30.2 
 
 
717 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  27.21 
 
 
556 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  28.06 
 
 
556 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  27.49 
 
 
563 aa  84  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  29.24 
 
 
541 aa  84  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  26.68 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  27.85 
 
 
571 aa  77  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  27.13 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  26.61 
 
 
762 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  25.6 
 
 
542 aa  62.4  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  25 
 
 
659 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  25.99 
 
 
576 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  26.27 
 
 
651 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>