54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2134 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1031    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  48.81 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  35.3 
 
 		 554 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  33.57 
 
 		 571 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  34.68 
 
 		 542 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  30.68 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  31.75 
 
 		 566 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  28.02 
 
 		 589 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  27.87 
 
 		 626 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  28.71 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  29.31 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  29.31 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  26.32 
 
 		 596 aa  97.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  26.32 
 
 		 590 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  29.59 
 
 		 552 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  29.59 
 
 		 552 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  28.12 
 
 		 541 aa  94  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  28.39 
 
 		 608 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  29.26 
 
 		 602 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 		 596 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  29.26 
 
 		 602 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  29.09 
 
 		 602 aa  90.5  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  28.93 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  28.93 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  28.93 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  29.58 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  27.38 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  29.47 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  29.11 
 
 		 678 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  33.8 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  28.5 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  27.05 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  30.22 
 
 		 651 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  26.71 
 
 		 573 aa  67  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  25.19 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  26.5 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  27.19 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  27.23 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  29 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  48.15 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  48.15 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  48.15 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  48.15 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  46.3 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  49.12 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  46.3 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  32.82 
 
 		 625 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  28.75 
 
 		 717 aa  47.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  25.88 
 
 		 649 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  33.08 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  34.48 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  42.37 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  38.36 
 
 		 418 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.39 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>