42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0838 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1273    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  41.77 
 
 		 659 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  38.85 
 
 		 678 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  38.79 
 
 		 672 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  41.51 
 
 		 556 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  39.05 
 
 		 556 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  30.85 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  34.11 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  28.75 
 
 		 604 aa  90.5  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  30.35 
 
 		 590 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  30.08 
 
 		 596 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  28.23 
 
 		 626 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  27.48 
 
 		 589 aa  77  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  29.69 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  29.69 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  29.69 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  28.37 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  28.37 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  29.23 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  28.13 
 
 		 602 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  28.22 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  27.58 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  26.33 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  26.33 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  29.37 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  25.82 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2439  membrane protein-like  36.96 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  26.58 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  30.68 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  31.45 
 
 		 595 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 596 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  28.53 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  25.11 
 
 		 717 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  27.42 
 
 		 573 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  26.29 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  30.41 
 
 		 543 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  29.92 
 
 		 566 aa  47.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  29.59 
 
 		 621 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  28.84 
 
 		 648 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  40.24 
 
 		 575 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  42 
 
 		 417 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  40 
 
 		 424 aa  43.9  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>