26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3507 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  100 
 
 		 573 aa  1118    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  27.16 
 
 		 554 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  26.72 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  26.98 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  26.19 
 
 		 571 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  25.41 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  26.23 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  26.23 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  28.32 
 
 		 576 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  27.12 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  24.63 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  24.63 
 
 		 596 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  25.57 
 
 		 608 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  27.1 
 
 		 575 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  25.51 
 
 		 543 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  23.94 
 
 		 602 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  23.94 
 
 		 602 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  23.64 
 
 		 602 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  23.64 
 
 		 602 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  23.64 
 
 		 602 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  23.77 
 
 		 602 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  23.47 
 
 		 568 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  24.29 
 
 		 603 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  26.42 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  25.32 
 
 		 626 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  26.48 
 
 		 598 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>