More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0670 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0670  SufBD  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0198  SufBD  61.86 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  44.86 
 
 		 360 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  40.56 
 
 		 425 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  48.12 
 
 		 399 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  37.2 
 
 		 424 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  40 
 
 		 424 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  36.87 
 
 		 438 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  42.29 
 
 		 454 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  36.23 
 
 		 424 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  36.92 
 
 		 422 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  39.9 
 
 		 690 aa  128  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  37.57 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  37.13 
 
 		 441 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  38.1 
 
 		 441 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  36.97 
 
 		 421 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  41.46 
 
 		 430 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  37.42 
 
 		 437 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  44.87 
 
 		 447 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  35.12 
 
 		 425 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  35.12 
 
 		 425 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  35.55 
 
 		 342 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  36.17 
 
 		 425 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  40.11 
 
 		 437 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  34.63 
 
 		 425 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  39.88 
 
 		 446 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  36.41 
 
 		 440 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  38.98 
 
 		 459 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  36.36 
 
 		 446 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  38.86 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  36.45 
 
 		 437 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  36.45 
 
 		 439 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  36.45 
 
 		 437 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  34.86 
 
 		 447 aa  117  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  38.41 
 
 		 433 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  37.36 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  34.76 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  34.92 
 
 		 428 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  34.92 
 
 		 428 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  37.5 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  37.33 
 
 		 439 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  36.57 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 445 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  42.74 
 
 		 439 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  42.98 
 
 		 436 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  35.93 
 
 		 426 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  37.71 
 
 		 444 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  37.06 
 
 		 446 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  35.9 
 
 		 419 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  36.36 
 
 		 418 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  36.09 
 
 		 445 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  33.52 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  34.87 
 
 		 437 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  38.67 
 
 		 437 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  33.67 
 
 		 437 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  35.64 
 
 		 426 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  36.76 
 
 		 439 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  39.17 
 
 		 434 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  43.85 
 
 		 430 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  36.65 
 
 		 420 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  38.41 
 
 		 439 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  43.75 
 
 		 448 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  31.96 
 
 		 439 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  35.96 
 
 		 427 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  39.72 
 
 		 444 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  31.43 
 
 		 475 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  37.35 
 
 		 440 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  37.35 
 
 		 440 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  37.35 
 
 		 440 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.57 
 
 		 448 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.57 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  43.55 
 
 		 427 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  31.89 
 
 		 467 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  30.48 
 
 		 423 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  30.48 
 
 		 423 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.48 
 
 		 423 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.48 
 
 		 423 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  30.48 
 
 		 423 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  31.05 
 
 		 383 aa  98.2  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.48 
 
 		 423 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.65 
 
 		 423 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.65 
 
 		 423 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  30.11 
 
 		 430 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  33.5 
 
 		 343 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.18 
 
 		 441 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.18 
 
 		 441 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.48 
 
 		 423 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.65 
 
 		 423 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.65 
 
 		 423 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.65 
 
 		 423 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.95 
 
 		 423 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  33.73 
 
 		 416 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 		 454 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.49 
 
 		 439 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.48 
 
 		 423 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 455 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 455 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 		 430 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  32.18 
 
 		 427 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>