More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03041 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  100 
 
 		 416 aa  833    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  51.03 
 
 		 397 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2280  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  53.98 
 
 		 392 aa  352  8e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.69897  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  38.55 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  38.52 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  35.51 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  30.99 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00821  ABC transporter, membrane component  32 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.714133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  33.9 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0073  ABC transporter, membrane component  31.1 
 
 		 405 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00831  ABC transporter, membrane component  30.81 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.208147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.43 
 
 		 442 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  31.59 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  31.27 
 
 		 448 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  32.59 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  29.81 
 
 		 419 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  29.1 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  29.1 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  33.09 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  33.95 
 
 		 383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  34.69 
 
 		 399 aa  156  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  30.66 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  38.05 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  30.41 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.99 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  32.15 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  27.9 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  29.89 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  37.18 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  37.18 
 
 		 428 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  30.43 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 437 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  31.46 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.89 
 
 		 437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  31.23 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.64 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.4 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.15 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.9 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.15 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.73 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.9 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.9 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  28.9 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  31.62 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  28.9 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.38 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.67 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  31.9 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  35.68 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  36.07 
 
 		 441 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  33.19 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  28.41 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.29 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.89 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  26.03 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.38 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  35.89 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  30.47 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.21 
 
 		 439 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  31.13 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  28.03 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.5 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  31.47 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  29.19 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  31.12 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.89 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  30.5 
 
 		 445 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  29.6 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  33.99 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  31.87 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  30.43 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  33.6 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  32.18 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  31.02 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.34 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  30.11 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.25 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  25.5 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0463  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.35 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.366005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  42.03 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  27.14 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  32.89 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  29.17 
 
 		 446 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.34 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  27.46 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  27.76 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  30.39 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  27.96 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  26.14 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  29.44 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  25.35 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  27.51 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>