More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0662 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  50.22 
 
 
681 aa  676    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  100 
 
 
704 aa  1442    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  40.54 
 
 
720 aa  542  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35 
 
 
699 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  33.88 
 
 
691 aa  362  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  33.88 
 
 
691 aa  362  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  34.16 
 
 
706 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  34.16 
 
 
706 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  34.41 
 
 
706 aa  347  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  34.69 
 
 
710 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  34.59 
 
 
709 aa  346  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  34.16 
 
 
706 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.1 
 
 
692 aa  345  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  34.35 
 
 
708 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  34.69 
 
 
706 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  34.69 
 
 
706 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  34.06 
 
 
705 aa  343  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  33.73 
 
 
696 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
680 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  34.09 
 
 
710 aa  337  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  33.66 
 
 
710 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  33.52 
 
 
710 aa  333  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  31.78 
 
 
709 aa  333  9e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  33.66 
 
 
710 aa  333  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  33.67 
 
 
707 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  34.01 
 
 
710 aa  332  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  33.77 
 
 
708 aa  328  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  33.24 
 
 
708 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  31.85 
 
 
717 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  33.71 
 
 
711 aa  326  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  31.85 
 
 
717 aa  326  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  32.29 
 
 
717 aa  323  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  32.38 
 
 
717 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  32.23 
 
 
717 aa  323  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.14 
 
 
717 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  32.23 
 
 
717 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  32.23 
 
 
717 aa  321  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  31.96 
 
 
704 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  31.03 
 
 
708 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  30.64 
 
 
708 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.17 
 
 
708 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  31.03 
 
 
708 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  31.03 
 
 
708 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  30.55 
 
 
697 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.89 
 
 
708 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  30.75 
 
 
708 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  30.89 
 
 
708 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  31.37 
 
 
712 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 
708 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
688 aa  286  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  35.78 
 
 
583 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  24.9 
 
 
709 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  24.37 
 
 
602 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  24.37 
 
 
602 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 
695 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.85 
 
 
671 aa  127  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  27.52 
 
 
625 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  23.27 
 
 
679 aa  122  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  25.07 
 
 
636 aa  121  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  25.15 
 
 
700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  22.94 
 
 
701 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  23.94 
 
 
610 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  24.21 
 
 
738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  23.79 
 
 
646 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  24.96 
 
 
739 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  23.95 
 
 
639 aa  111  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  26.61 
 
 
596 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 
607 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.65 
 
 
694 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  23.61 
 
 
600 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  26.55 
 
 
548 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  23.94 
 
 
681 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 
553 aa  107  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1280  peptidoglycan glycosyltransferase  26.46 
 
 
888 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547903  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  25.92 
 
 
646 aa  106  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  25.05 
 
 
596 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  24 
 
 
687 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4774  penicillin-binding protein transpeptidase  25.15 
 
 
750 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00431  putative penicillin-binding protein  26.21 
 
 
548 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.876633  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  27 
 
 
548 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  25.97 
 
 
627 aa  104  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  24.1 
 
 
612 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  25.35 
 
 
636 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  24.1 
 
 
612 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0652  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.76 
 
 
699 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 
638 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  23.34 
 
 
727 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  22.54 
 
 
645 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  23.66 
 
 
727 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1673  peptidoglycan glycosyltransferase  26.79 
 
 
899 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  25.35 
 
 
609 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 
839 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  26.2 
 
 
739 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  22.96 
 
 
683 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  24.95 
 
 
609 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  21.96 
 
 
703 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  26.24 
 
 
647 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  22.32 
 
 
801 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  25 
 
 
634 aa  99.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  24.05 
 
 
643 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>