More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1117 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  100 
 
 		 696 aa  1416    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  84.81 
 
 		 691 aa  1204    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  84.81 
 
 		 691 aa  1204    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  43.92 
 
 		 708 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  42.92 
 
 		 706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  42.67 
 
 		 710 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  42.74 
 
 		 709 aa  561  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  43.29 
 
 		 708 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  44.41 
 
 		 705 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  43.12 
 
 		 706 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  42.63 
 
 		 706 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  42.49 
 
 		 706 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  42.49 
 
 		 706 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  42.84 
 
 		 706 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  42.3 
 
 		 710 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  42.3 
 
 		 708 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  42.86 
 
 		 707 aa  545  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  43.36 
 
 		 708 aa  545  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  43.12 
 
 		 708 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  43.12 
 
 		 708 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  43.56 
 
 		 708 aa  545  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  42.96 
 
 		 711 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  43.12 
 
 		 708 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  41.46 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  43.12 
 
 		 708 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  43.88 
 
 		 708 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  42.41 
 
 		 709 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  42.63 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  43.72 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  41.88 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  42.9 
 
 		 710 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  43.14 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  43.31 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  43.17 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  43.17 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  43.17 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  43.17 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  43.43 
 
 		 704 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  43.66 
 
 		 697 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  42.86 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  43.17 
 
 		 717 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  42.57 
 
 		 717 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  43.64 
 
 		 712 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  42.71 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.1 
 
 		 699 aa  350  4e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.87 
 
 		 680 aa  342  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  35.68 
 
 		 681 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  34.54 
 
 		 704 aa  323  8e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  31.41 
 
 		 720 aa  317  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.78 
 
 		 692 aa  296  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.56 
 
 		 688 aa  282  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  27.17 
 
 		 701 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  23.52 
 
 		 655 aa  164  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  24.42 
 
 		 687 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  26.35 
 
 		 607 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.51 
 
 		 694 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  24.73 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  26 
 
 		 705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  25.69 
 
 		 625 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  24.96 
 
 		 618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  24.96 
 
 		 618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  24.75 
 
 		 618 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.42 
 
 		 639 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  24.5 
 
 		 629 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  24.38 
 
 		 667 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  25.55 
 
 		 643 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  26.01 
 
 		 619 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  24.82 
 
 		 618 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  24.34 
 
 		 602 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  24.34 
 
 		 602 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  24.71 
 
 		 618 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  24.69 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.75 
 
 		 646 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  24.69 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  24.69 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  24.41 
 
 		 627 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  24.69 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  24.83 
 
 		 700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  23.76 
 
 		 629 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  24.21 
 
 		 629 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.81 
 
 		 618 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  24.05 
 
 		 673 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.59 
 
 		 633 aa  140  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  25.32 
 
 		 643 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  23.9 
 
 		 629 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  24.45 
 
 		 630 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  24.06 
 
 		 629 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 		 646 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  24.96 
 
 		 655 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  24.62 
 
 		 800 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  26.13 
 
 		 637 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  23.92 
 
 		 629 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 		 671 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  26.6 
 
 		 618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  23.84 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  24.38 
 
 		 802 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 		 618 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>