More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0385 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  100 
 
 		 720 aa  1465    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  40.91 
 
 		 704 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  38.27 
 
 		 681 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.4 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.19 
 
 		 699 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.19 
 
 		 680 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  32.13 
 
 		 705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  31.73 
 
 		 710 aa  333  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 708 aa  324  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 706 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 709 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  30.35 
 
 		 706 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  30.35 
 
 		 706 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  30.35 
 
 		 706 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  32.12 
 
 		 691 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  32.12 
 
 		 691 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  30.55 
 
 		 708 aa  316  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  30.64 
 
 		 706 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  31.98 
 
 		 710 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 710 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  30.36 
 
 		 706 aa  313  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  29.49 
 
 		 709 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 710 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  31.79 
 
 		 711 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 710 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  31.51 
 
 		 710 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  31.51 
 
 		 707 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  32.51 
 
 		 708 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 717 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 717 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 717 aa  302  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 717 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 717 aa  300  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 717 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  30.54 
 
 		 717 aa  297  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  30.51 
 
 		 717 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  30.03 
 
 		 704 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  31.3 
 
 		 696 aa  294  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  30.53 
 
 		 712 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.78 
 
 		 688 aa  288  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  29.35 
 
 		 708 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 708 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  29.64 
 
 		 697 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  29.56 
 
 		 708 aa  286  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.03 
 
 		 708 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.88 
 
 		 708 aa  283  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 708 aa  283  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  29.67 
 
 		 708 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 708 aa  283  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 		 708 aa  281  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  32.72 
 
 		 583 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  25.24 
 
 		 709 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  25.42 
 
 		 625 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  24.89 
 
 		 701 aa  153  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  25.69 
 
 		 655 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 694 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.83 
 
 		 705 aa  140  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.54 
 
 		 695 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  23.92 
 
 		 658 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.17 
 
 		 671 aa  125  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 		 636 aa  125  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.22 
 
 		 640 aa  125  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  25.81 
 
 		 646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  25.97 
 
 		 645 aa  120  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 		 839 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 670 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  27 
 
 		 646 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  24.8 
 
 		 643 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  24.48 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  26.95 
 
 		 644 aa  112  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  23.98 
 
 		 638 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  24.86 
 
 		 626 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  24.7 
 
 		 647 aa  111  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  23.69 
 
 		 609 aa  111  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 		 639 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1673  peptidoglycan glycosyltransferase  24.96 
 
 		 899 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  24.67 
 
 		 681 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 		 645 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  26.68 
 
 		 647 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  24.03 
 
 		 634 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  26.31 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  24.4 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  23.97 
 
 		 618 aa  107  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  24.12 
 
 		 697 aa  107  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  22.33 
 
 		 738 aa  107  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  24.51 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  25.52 
 
 		 634 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0652  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.43 
 
 		 699 aa  106  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  26.32 
 
 		 596 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 631 aa  105  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  25.73 
 
 		 631 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  25.5 
 
 		 611 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  26.8 
 
 		 600 aa  104  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  24.21 
 
 		 800 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2501  penicillin-binding protein  26.46 
 
 		 585 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  22.87 
 
 		 629 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  22.79 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>